В Телецкое озеро впадает более 70 рек. Самая крупная из них — Чулышман, которая питает водоем примерно на 70%. Ее протяженность — 241 км.
В течение года вода меняет свой цвет. Осенью он прозрачно-бирюзовый, а весной и летом — мутный бежево-желтый.
Телецкое озеро — проточное. Мутные воды Чулышмана начали свое движение и к середине июня достигли кордона Челюш.

«На фото южной части озера и долины Чулышмана (18.06.2023) можно увидеть речную воду, которая перемещается вдоль правого берега, не смешиваясь с тёмной озёрной из-за разности температур (температура в поверхностных слоях речной воды достигает +14°С, а озерной +4°С) и скорости потока», — рассказали в заповеднике.
Ранее в Барнаулке обнаружили маслянистые пятна. В связи с этим ввели режим повышенной готовности.