По версии следствия, Труфанов подозревается в получении денежного вознаграждения от представителя дорожной организации, являвшейся подрядчиком «Горно-Алтайавтодора». Взамен он, предположительно, подписывал документы, подтверждающие выполнение работ, которые фактически не были произведены. Кроме того, следствие полагает, что он совершал иные противозаконные действия в интересах этой организации.
Операция по выявлению преступления проводилась совместно следователями регионального следственного управления и сотрудниками УФСБ России по Республике Алтай. В ходе обыска в жилище Труфанова были изъяты денежные средства в размере более 2 миллионов рублей.
В настоящее время следователь готовит ходатайство в суд об избрании меры пресечения в виде заключения под стражу. Следственное управление СКР по Республике Алтай также опубликовало оперативное видео задержания Труфанова. Ведется комплекс следственных и процессуальных действий, направленных на установление всех обстоятельств дела.