К 8 февраля 1992 года Верховный Совет Горно-Алтайской ССР переименовал ее в Республику Горный Алтай. 7 мая 1992 года Верховный Совет Республики Алтай переименовал регион и он получил свое нынешнее название Республика Алтай. Теперь республика имеет свою конституцию, принятую 7 июня 1997 года, и государственные символы — флаг и герб. Государственные языки — алтайский и русский.
Ученые считают, что первые люди появились здесь 1,5 млн лет назад. С 8 по 2 века до нашей эры здесь жили скифы. В конце этого периода возникло государство, которое потом разгромили кочевники. За 200 лет до нашей эры эти земли отошли тюркским племенам. В 4-6 веках территория современной Республики Алтай была частью монголоязычного Жужаньского каганата. С 6 века ее забирают гунны, потом (в 13 веке) монголы. В 14 веке территория распадается на отдельные объединения. Она оставалась частью монгольских Северная Юань и Джунгарское ханств до 1758 года. Когда сюда пришли русские первопроходцы, это было Джунгарское ханство.
После его падения в середине 18 века алтайцы добровольно перешли в состав Российской империи. После гражданской войны 20 века здесь образовали Ойратскую автономную область в составе Алтайской губернии, которая позднее переименовали в Ойротскую, далее — в Горно-Алтайскую. В 1990 году статус территории повышен до автономной республики (АССР).